Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms