Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms