Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms