Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms