Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TefmQ5SSK3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms