Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms