Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38aQ4FK66 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms