Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lin28bQ45KJ6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lin28bQ45KJ6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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