Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pacs2Q3V3Q7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacs2Q3V3Q7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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