Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms