Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms