Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms