Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms