Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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