Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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