Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skap2Q3UND0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms