Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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