Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx27Q3UHD6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx27Q3UHD6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx27Q3UHD6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx27Q3UHD6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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