Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms