Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LbrQ3U9G9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms