Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtpbp6Q3U6U5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms