Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem35bQ3U0Y2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms