Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms