Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam107bQ3TGF2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms