Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RubcnlQ3TD16 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms