Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cul4aQ3TCH7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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