Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rpusd2Q149F1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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