Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms