Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms