Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

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Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col19a1Q0VF58 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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