Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms