Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms