Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms