Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc4Q08624 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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