Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms