Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms