Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cab39Q06138 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms