Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdk18Q04899 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms