Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms