Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GscQ02591 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GscQ02591 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GscQ02591 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GscQ02591 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms