Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms