Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col1a2Q01149 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms