Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms