Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms