Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms