Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp10Q000W5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms