Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms