Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms