Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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