Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms